Nadahnut muzeografijom 19. pa čak i 18. stoljeća, stalni postav zoologije ima pomalo starinski šarm. Očekuju vas impresivni komadi, poput tigra, losa ili velike bijele psine. S 5m89, naš je morski pas najveći naturalizirani primjerak na svijetu!
Izumrle životinje
Zoološki zavod posjeduje malu, ali vrlo vrijednu zbirku izumrlih životinja. Njima je posvećena soba, u kojoj se razmatraju prijetnje koje trenutačno opterećuju biološku raznolikost i načine njezina očuvanja.
Kabinet komparativne anatomije
Namijenjen za sveučilišnu nastavu, ovaj "muzej muzeja" doživio je nekoliko preinaka i još uvijek nudi svoj impresivan spektakl nizova ćupova i kostura. Vitrina koju je dizajnirala umjetnica Sabrina Biro pod nazivom "Dvostruko čudovište" prikazuje dvoglave životinje. Izlaganje zaokružuje izložba o beskralježnjacima.
Prostor kriptozoologije
Naš muzej ima najveću svjetsku zbirku kriptozoologije, znanosti o životinjama za koju nismo sigurni da postoji. Tome je posvećen prostor u kabinetu komparativne anatomije.